Karol Marhold: Súčasný stav medzinárodných nomenklatorických, taxonomických a chorologických databáz

Vedný odbor Biodiversity Informatics (zahŕňajúci informatické aplikácie v štúdiu biodiverzity) je u nás aspoň pod týmto označením pomerne neznámy, hoci v celosvetovom meradle je už dobre zavedený a to nielen v rámci univerzitných študijných programov ale aj v bežnej praxi. S produktmi tohto vedného odboru, ktoré vznikli väčšinou ako výsledok veľkých medzinárodných projektov alebo aktivít veľkých botanických inštitúcií, sa však stretávame v každodennej botanickej praxi.

V oblasti nomenklatúry je to najmä databáza International Plant Names Index (IPNI), ktorá zahŕňa všetky platne uverejnené druhové mená vyšších rastlín a z posledných desaťročí aj mená infrašpecifických taxónov. Ďalšie databázy, ktoré sú však rôzneho geografického pokrytia, rôznej kvality a rôznej miery rozpracovanosti, obsahujú autoritatívne zoznamy akceptovaných mien a synoným. Sem patria napr. Tropicos, Euro+Med PlantBase, The Plant List, Plants of the World online alebo World Flora Online.

Osobitnou kategóriou sú webové portály sprístupňujúce digitalizovanú taxonomickú literatúru, ako napr. Biodiversity Heritage Library, Biblioteca Digital (Real Jardín Botánico, Madrid) alebo Botanicus (Missouri Botanical Garden), ktoré neuveriteľne uľahčujú prístup prakticky ku všetkej starej literatúre.

Mnohé inštitúcie prezentujú svoje herbárové zbierky v digitalizovanej podobe. Celosvetovo asi najväčším prispievateľom je tu Muséum national d’Histoire naturelle v Paríži, z globálnych zdrojov treba spomenúť portál JSTOR Global Plants, sprístupňujúci digitalizované typové herbárové doklady a niektoré ďalšie dôležité herbárové zbierky. Prispieva sem viac ako 300 inštitucionálnych herbárov z celého sveta viac než 2,2 miliónmi herbárových položiek v digitálnej podobe. Databáza Global Biodiversity Information Facility (GBIF) okrem odkazov na herbárové doklady a zoologické zbierkové objekty zahŕňa aj výsledky pozorovaní, ktoré nie sú priamo dokladované. Viac ako 47 tisíc dátových súborov tu obsahuje viac ako 1,35 miliardy údajov o lokalitách výskytu rôznych organizmov. Hoci tieto údaje majú premenlivú kvalitu a pred použitím je ich potrebné väčšinou filtrovať, ide o najdôležitejší zdroj informácií o rozšírení organizmov v globálnom meradle, ktorý máme v súčasnosti k dispozícii.

 

Odkazy:

Biodiversity Information Standards (TDWG)

Index Herbariorum (NYBG Steere Herbarium)

The International Plant Names Index

Index of Botanists (Harvard University Herbaria & Libraries)

Tropicos

The Plant List

World Flora Online

Plants of the World online

The Euro+Med PlantBase

World Checklist of Selected Plant Families (WCSP)

Global Biodiversity Information Facility (GBIF)

JSTOR Global Plants

Virtual Herbaria Jacq

Muséum national d’Histoire naturelle

Botanicus Digital Library (Missouri Botanical Garden)

Real Jardín Botánico — Digital Library

Biodiversity Heritage Library