Zatímco v českých muzeích se elektronické databáze používají ke katalogizaci sbírek už od počátku devadesátých let, zůstávaly Herbářové sbírky Univerzity Karlovy (PRC) a herbář Masarykovy univerzity (BRNU) dlouho bez elektronických katalogů.

Šíření nepůvodních druhů rostlin významně ovlivňuje současnou vegetaci a v mnoha případech může mít dalekosáhlé následky. Je tedy důležité zjistit, které biotopy jsou nejvíce ohrožené a které faktory k tomu přispívají. Díky rozsáhlé vegetační databázi EVA (European Vegetation Archive) je možné studovat zastoupení neofytů v různých vegetačních typech na úrovni celé Evropy.

PALYCZ je česká kvartérní pylová databáze, která shromažďuje pylové sekvence především z území České a Slovenské republiky. Její uživatelé mohou na adrese https://botany.natur.cuni.cz/palycz/ vybírat lokality z mapy nebo seznamu, procházet jejich depth-age modely, datování i pylové počty pro jednotlivé hloubky. Vybrané lokality jsou opatřeny fotodokumentací z odběrů a na žádost lze zpřístupnit originální publikace nebo backup celé databáze.